Fransa'nın "Sanat ve Edebiyat Şövalyesi Nişanı", "T.C.Devlet Üstün Hizmet Madalyasıyla ödüllendirilen Eczacıbaşı, 1993'ten ölümüne dek "İstanbul Kültür ve Sanat Vakfı'nın Yönetim Kurulu Başkanlığı'nı yaptı.
1929 yılında İzmir'de doğdu.
Robert Kolej'i bitirdikten sonra, yüksek öğrenimini Londra Üniversitesi'nde eczacılık dalında yaptı.
Türkiye'ye döndükten sonra bir süre gazetecilik yaptı. Bu yıllarda çıkardığı dergilerden ikisi "Sanat Yaprağı" ve "Tıpta Yenilikler" adlarını taşıyordu.
Ailesinin başında olduğu "Eczacıbaşı" şirketinin yaptığı "Eczacıbaşı Kültür Filmleri" dizisinden birini o çekti. "Renk Duvarları" adını taşıyan bu belgesel film 1964 yılında Avrupa Konseyi'nin "Kültür Filmleri Ödülü" nü kazandı.
Türk Sinematek Derneği'nin kurucuları arasındaydı ve bu derneğin 10 yıl süreyle başkanlığını yaptı. 1993'ten beri de "İstanbul Kültür ve Sanat Vakfı'nın Yönetim Kurulu Başkanıydı.
1970'li yıllarda Eczacıbaşı İlaç Kuruluşu Genel Müdürü, 1980'de Eczacıbası Topluluğu icra Kurulu Başkanı, 1993'te ise Eczacıbaşı Holding Yönetim Kurulu Başkanı oldu. 1996'da iş yaşamını bıraktı.
Şakir Eczacıbaşı aynı zamanda bir fotoğraf sanatçısıydı. Türkiye'de 13, Türkiye dışında da 23 kişisel fotoğraf sergisi düzenledi. Çektiği bazı fotoğrafları "Anlar/Moments", "Türkiye Renkleri", "Kapılar Pencereler" gibi albümlerde topladı.
Eczacıbaşı şirketinin 1960'lı yıllardan beri çıkarmakta olduğu takvimlerde ("Eczacıbaşı Renkli Fotoğraf Yıllıkları") Türkiye'nin önde gelen fotoğraf sanatçılarıyla birlikte onun fotoğrafları da yer alıyordu ve birer sanat portfolyosu niteliğindeki bu albümlerin editörlüğünü de yapmıştı.
Ayrıca "Türkiye: Bir Portre" ve "İstanbul Görüntüleri" adlarıyla, seçkin yazar ve fotoğraf sanatçılarının katıldığı iki kitap hazırladı.
24 Ocak 2010 (81 yaşında) İstanbul'da öldü.
